サービス概要
次世代シーケンサーを用いて、ゲノム配列が既知である生物種(リファレンス配列のある生物種)についてゲノムDNAのシーケンスを行い、取得した配列情報を、既知のリファレンス配列に対してマッピングを行い、塩基の置換や逆位、SNPs、small Insertion/Deletion 等の変異解析を行います。
また、ヒトの場合は、SV(Structural Variant, 構造変異)、CNV(Copy Number Variation, コピー数変動)の解析も可能です。
ゲノムサイズに応じて、取得するデータ量を調整します。
基本的には、イルミナ社のショートリードのシーケンサーを利用します。
実施可能なアプリケーション例
ショットガンシーケンス(DNAシーケンス)
内容
イルミナ社のショートリードのシーケンサー(NovaSeq X Plus)を用いて、低コストに大量のデータを取得します。
取得データ量の目安は、ゲノムサイズの30倍程度になります。
代表的な仕様
ライブラリ調製:TruSeq DNA PCR-Free もしくは TruSeq DNA nano Kit
シーケンス条件:NovaSeq X Plus, 150bp, paired end, 数~数十Gb /sample
データ解析 :マッピング、SNP 解析、small In/Del 解析、CNV, SV
※ CNV, SVは、ヒトの場合のみの対応となります。
納期
シーケンスのみご依頼の場合:サンプル受領から約 4-6 週間
データ解析までご依頼の場合:サンプル受領から約 8 週間
サンプル受領のタイミングや取得したデータによっては、納期が前後する場合がありますので、ご了承ください。
ご依頼の流れ
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FAQ
品質チェックや納品物に関するよくあるご質問については、こちらをご覧ください。
お問い合わせ先
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