サービス概要

次世代シーケンサーを用いて、ゲノム配列が既知である生物種（リファレンス配列のある生物種）についてゲノムDNAのシーケンスを行い、取得した配列情報を、既知のリファレンス配列に対してマッピングを行い、塩基の置換や逆位、SNPs、small Insertion/Deletion 等の変異解析を行います。
また、ヒトの場合は、SV(Structural Variant, 構造変異)、CNV(Copy Number Variation, コピー数変動)の解析も可能です。

ゲノムサイズに応じて、取得するデータ量を調整します。
基本的には、イルミナ社のショートリードのシーケンサーを利用します。

実施可能なアプリケーション例

ショットガンシーケンス（DNAシーケンス）

内容

イルミナ社のショートリードのシーケンサー（NovaSeq X Plus）を用いて、低コストに大量のデータを取得します。
取得データ量の目安は、ゲノムサイズの30倍程度になります。

代表的な仕様

　ライブラリ調製：TruSeq DNA PCR-Free もしくは TruSeq DNA nano Kit
　シーケンス条件：NovaSeq X Plus, 150bp, paired end, 数～数十Gb /sample
　データ解析　　：マッピング、SNP 解析、small In/Del 解析、CNV, SV
　※ CNV, SVは、ヒトの場合のみの対応となります。

納期

シーケンスのみご依頼の場合：サンプル受領から約 4-6 週間
データ解析までご依頼の場合：サンプル受領から約 8 週間

サンプル受領のタイミングや取得したデータによっては、納期が前後する場合がありますので、ご了承ください。

ご依頼の流れ

フォームからのお問い合わせは、下記のお問い合わせボタンより、必要事項をご記載の上、送信ください。
メールでのお問い合わせは、bio@apro-s.com までご連絡ください。
お電話でのお問い合わせは、088-678-6372 までご連絡ください。

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